Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBN1Q16643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DBN1Q16643 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DBN1Q16643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DBN1Q16643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DBN1Q16643 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DBN1Q16643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBN1Q16643 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBN1Q16643 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms