Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FXNQ16595 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FXNQ16595 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FXNQ16595 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FXNQ16595 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FXNQ16595 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FXNQ16595 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FXNQ16595 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FXNQ16595 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FXNQ16595 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FXNQ16595 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FXNQ16595 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FXNQ16595 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FXNQ16595 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FXNQ16595 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FXNQ16595 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FXNQ16595 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FXNQ16595 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FXNQ16595 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FXNQ16595 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FXNQ16595 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FXNQ16595 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FXNQ16595 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FXNQ16595 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FXNQ16595 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FXNQ16595 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FXNQ16595 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FXNQ16595 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FXNQ16595 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FXNQ16595 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FXNQ16595 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FXNQ16595 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FXNQ16595 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FXNQ16595 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FXNQ16595 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FXNQ16595 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FXNQ16595 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FXNQ16595 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FXNQ16595 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FXNQ16595 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FXNQ16595 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FXNQ16595 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FXNQ16595 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FXNQ16595 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FXNQ16595 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FXNQ16595 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FXNQ16595 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FXNQ16595 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FXNQ16595 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FXNQ16595 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FXNQ16595 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FXNQ16595 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FXNQ16595 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FXNQ16595 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FXNQ16595 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FXNQ16595 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FXNQ16595 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FXNQ16595 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FXNQ16595 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FXNQ16595 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FXNQ16595 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FXNQ16595 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FXNQ16595 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FXNQ16595 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FXNQ16595 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FXNQ16595 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FXNQ16595 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FXNQ16595 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FXNQ16595 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FXNQ16595 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FXNQ16595 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FXNQ16595 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FXNQ16595 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FXNQ16595 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FXNQ16595 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FXNQ16595 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FXNQ16595 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FXNQ16595 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FXNQ16595 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FXNQ16595 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FXNQ16595 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FXNQ16595 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FXNQ16595 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FXNQ16595 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FXNQ16595 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FXNQ16595 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FXNQ16595 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FXNQ16595 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FXNQ16595 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FXNQ16595 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FXNQ16595 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FXNQ16595 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FXNQ16595 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FXNQ16595 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FXNQ16595 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FXNQ16595 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FXNQ16595 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FXNQ16595 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FXNQ16595 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FXNQ16595 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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