Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARTPTQ16568 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARTPTQ16568 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CARTPTQ16568 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARTPTQ16568 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARTPTQ16568 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARTPTQ16568 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CARTPTQ16568 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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