Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1EQ15878 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1EQ15878 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1EQ15878 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1EQ15878 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1EQ15878 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1EQ15878 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1EQ15878 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1EQ15878 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA1EQ15878 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms