Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF2Q15853 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF2Q15853 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF2Q15853 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USF2Q15853 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF2Q15853 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF2Q15853 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USF2Q15853 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USF2Q15853 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USF2Q15853 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USF2Q15853 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USF2Q15853 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USF2Q15853 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USF2Q15853 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USF2Q15853 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF2Q15853 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF2Q15853 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USF2Q15853 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USF2Q15853 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USF2Q15853 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USF2Q15853 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USF2Q15853 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USF2Q15853 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USF2Q15853 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USF2Q15853 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USF2Q15853 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USF2Q15853 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USF2Q15853 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USF2Q15853 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USF2Q15853 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USF2Q15853 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USF2Q15853 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USF2Q15853 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USF2Q15853 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USF2Q15853 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USF2Q15853 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USF2Q15853 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USF2Q15853 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USF2Q15853 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USF2Q15853 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USF2Q15853 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USF2Q15853 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USF2Q15853 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USF2Q15853 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USF2Q15853 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USF2Q15853 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USF2Q15853 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USF2Q15853 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USF2Q15853 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USF2Q15853 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USF2Q15853 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USF2Q15853 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USF2Q15853 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USF2Q15853 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USF2Q15853 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USF2Q15853 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USF2Q15853 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USF2Q15853 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USF2Q15853 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USF2Q15853 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USF2Q15853 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USF2Q15853 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USF2Q15853 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USF2Q15853 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USF2Q15853 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USF2Q15853 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USF2Q15853 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USF2Q15853 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USF2Q15853 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USF2Q15853 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USF2Q15853 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USF2Q15853 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USF2Q15853 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USF2Q15853 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USF2Q15853 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USF2Q15853 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USF2Q15853 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USF2Q15853 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USF2Q15853 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USF2Q15853 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USF2Q15853 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USF2Q15853 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USF2Q15853 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USF2Q15853 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USF2Q15853 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USF2Q15853 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USF2Q15853 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USF2Q15853 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USF2Q15853 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USF2Q15853 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USF2Q15853 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USF2Q15853 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USF2Q15853 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USF2Q15853 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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