Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGIF1Q15583 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGIF1Q15583 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGIF1Q15583 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGIF1Q15583 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGIF1Q15583 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGIF1Q15583 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGIF1Q15583 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGIF1Q15583 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGIF1Q15583 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGIF1Q15583 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TGIF1Q15583 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TGIF1Q15583 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
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