Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1Q15418 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1Q15418 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KA1Q15418 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KA1Q15418 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6KA1Q15418 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KA1Q15418 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KA1Q15418 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KA1Q15418 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KA1Q15418 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms