Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PSME4Q14997 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PSME4Q14997 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSME4Q14997 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSME4Q14997 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PSME4Q14997 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSME4Q14997 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PSME4Q14997 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSME4Q14997 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSME4Q14997 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSME4Q14997 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSME4Q14997 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSME4Q14997 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSME4Q14997 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PSME4Q14997 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PSME4Q14997 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
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