Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CACNA1SQ13698 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CACNA1SQ13698 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CACNA1SQ13698 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CACNA1SQ13698 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CACNA1SQ13698 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CACNA1SQ13698 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CACNA1SQ13698 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CACNA1SQ13698 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CACNA1SQ13698 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CACNA1SQ13698 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CACNA1SQ13698 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CACNA1SQ13698 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CACNA1SQ13698 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CACNA1SQ13698 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CACNA1SQ13698 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CACNA1SQ13698 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CACNA1SQ13698 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CACNA1SQ13698 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CACNA1SQ13698 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CACNA1SQ13698 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CACNA1SQ13698 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
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