Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB31Q13636 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB31Q13636 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB31Q13636 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB31Q13636 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB31Q13636 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB31Q13636 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB31Q13636 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB31Q13636 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB31Q13636 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB31Q13636 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB31Q13636 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB31Q13636 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB31Q13636 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB31Q13636 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB31Q13636 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB31Q13636 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB31Q13636 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB31Q13636 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB31Q13636 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB31Q13636 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB31Q13636 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB31Q13636 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms