Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms