Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRR1Q13601 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRR1Q13601 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRR1Q13601 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRR1Q13601 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRR1Q13601 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRR1Q13601 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRR1Q13601 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRR1Q13601 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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