Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKRN4PQ13434 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKRN4PQ13434 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MKRN4PQ13434 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MKRN4PQ13434 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MKRN4PQ13434 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MKRN4PQ13434 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MKRN4PQ13434 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MKRN4PQ13434 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MKRN4PQ13434 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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