Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRSF6Q13247 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRSF6Q13247 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRSF6Q13247 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRSF6Q13247 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRSF6Q13247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRSF6Q13247 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRSF6Q13247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRSF6Q13247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRSF6Q13247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF6Q13247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRSF6Q13247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRSF6Q13247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF6Q13247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF6Q13247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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