Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
GRIN2BQ13224 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.17■■■■■ 4.98
GRIN2BQ13224 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
GRIN2BQ13224 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.1■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
GRIN2BQ13224 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
GRIN2BQ13224 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
GRIN2BQ13224 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
GRIN2BQ13224 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
GRIN2BQ13224 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
GRIN2BQ13224 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
GRIN2BQ13224 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
GRIN2BQ13224 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
GRIN2BQ13224 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
GRIN2BQ13224 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
GRIN2BQ13224 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
GRIN2BQ13224 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
GRIN2BQ13224 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
GRIN2BQ13224 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
GRIN2BQ13224 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
GRIN2BQ13224 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
GRIN2BQ13224 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
GRIN2BQ13224 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
GRIN2BQ13224 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
GRIN2BQ13224 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
GRIN2BQ13224 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
GRIN2BQ13224 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
GRIN2BQ13224 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
GRIN2BQ13224 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
GRIN2BQ13224 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
GRIN2BQ13224 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
GRIN2BQ13224 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.58■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.57■■■■■ 4.89
GRIN2BQ13224 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
GRIN2BQ13224 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
GRIN2BQ13224 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
GRIN2BQ13224 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
GRIN2BQ13224 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.35■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
GRIN2BQ13224 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
GRIN2BQ13224 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
GRIN2BQ13224 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
GRIN2BQ13224 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
GRIN2BQ13224 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
GRIN2BQ13224 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
GRIN2BQ13224 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.23■■■■■ 4.83
GRIN2BQ13224 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
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