Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA3BQ13214 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA3BQ13214 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3BQ13214 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3BQ13214 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3BQ13214 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3BQ13214 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3BQ13214 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEMA3BQ13214 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3BQ13214 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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