Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL28Q13084 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL28Q13084 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL28Q13084 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL28Q13084 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL28Q13084 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL28Q13084 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL28Q13084 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL28Q13084 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL28Q13084 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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