Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC47.93■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
PRDM2Q13029 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
PRDM2Q13029 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC47.67■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
PRDM2Q13029 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
PRDM2Q13029 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.53■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
PRDM2Q13029 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
PRDM2Q13029 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
PRDM2Q13029 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC47.38■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC47.27■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC47.19■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC47.19■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC47.19■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC47.03■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
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