Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX9Q08211 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DHX9Q08211 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX9Q08211 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX9Q08211 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX9Q08211 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX9Q08211 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DHX9Q08211 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX9Q08211 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX9Q08211 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX9Q08211 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX9Q08211 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX9Q08211 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX9Q08211 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX9Q08211 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX9Q08211 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX9Q08211 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX9Q08211 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX9Q08211 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DHX9Q08211 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms