Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TGM3Q08188 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TGM3Q08188 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGM3Q08188 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGM3Q08188 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGM3Q08188 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM3Q08188 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms