Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBPJQ06330 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBPJQ06330 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBPJQ06330 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBPJQ06330 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBPJQ06330 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBPJQ06330 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBPJQ06330 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBPJQ06330 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBPJQ06330 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBPJQ06330 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBPJQ06330 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBPJQ06330 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBPJQ06330 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms