Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DEFA6Q01524 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA6Q01524 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA6Q01524 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA6Q01524 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA6Q01524 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA6Q01524 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms