Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1Q01196 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1Q01196 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNX1Q01196 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUNX1Q01196 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1Q01196 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNX1Q01196 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms