Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMAD3P84022 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMAD3P84022 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMAD3P84022 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMAD3P84022 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SMAD3P84022 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMAD3P84022 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMAD3P84022 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMAD3P84022 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMAD3P84022 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMAD3P84022 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SMAD3P84022 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SMAD3P84022 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMAD3P84022 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms