Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTAG1AP78358 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTAG1AP78358 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTAG1AP78358 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTAG1AP78358 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTAG1AP78358 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTAG1AP78358 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTAG1AP78358 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTAG1AP78358 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTAG1AP78358 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTAG1AP78358 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms