Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTG1P63261 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG1P63261 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTG1P63261 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTG1P63261 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTG1P63261 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTG1P63261 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTG1P63261 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTG1P63261 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTG1P63261 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTG1P63261 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTG1P63261 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms