Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS27AP62979 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS27AP62979 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS27AP62979 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS27AP62979 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS27AP62979 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27AP62979 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27AP62979 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms