Protein–RNA interactions for Protein: P60369

KRTAP10-3, Keratin-associated protein 10-3, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-3P60369 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP10-3P60369 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP10-3P60369 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-3P60369 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRTAP10-3P60369 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRTAP10-3P60369 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP10-3P60369 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP10-3P60369 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms