Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GSCP56915 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GSCP56915 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSCP56915 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GSCP56915 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GSCP56915 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GSCP56915 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GSCP56915 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSCP56915 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSCP56915 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSCP56915 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSCP56915 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSCP56915 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GSCP56915 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GSCP56915 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSCP56915 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSCP56915 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSCP56915 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSCP56915 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSCP56915 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GSCP56915 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSCP56915 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSCP56915 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSCP56915 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSCP56915 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSCP56915 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSCP56915 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSCP56915 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSCP56915 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSCP56915 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSCP56915 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSCP56915 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSCP56915 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSCP56915 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSCP56915 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSCP56915 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GSCP56915 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSCP56915 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSCP56915 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSCP56915 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSCP56915 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSCP56915 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSCP56915 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSCP56915 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GSCP56915 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSCP56915 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSCP56915 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GSCP56915 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GSCP56915 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSCP56915 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GSCP56915 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSCP56915 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSCP56915 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSCP56915 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSCP56915 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GSCP56915 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GSCP56915 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GSCP56915 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSCP56915 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSCP56915 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSCP56915 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSCP56915 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSCP56915 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSCP56915 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSCP56915 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSCP56915 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSCP56915 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GSCP56915 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSCP56915 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSCP56915 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSCP56915 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSCP56915 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GSCP56915 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GSCP56915 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GSCP56915 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GSCP56915 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GSCP56915 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GSCP56915 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GSCP56915 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GSCP56915 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GSCP56915 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GSCP56915 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GSCP56915 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GSCP56915 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GSCP56915 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GSCP56915 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GSCP56915 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GSCP56915 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GSCP56915 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GSCP56915 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GSCP56915 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSCP56915 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GSCP56915 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms