Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCL23P55773 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCL23P55773 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCL23P55773 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCL23P55773 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCL23P55773 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCL23P55773 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCL23P55773 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCL23P55773 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCL23P55773 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCL23P55773 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCL23P55773 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCL23P55773 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCL23P55773 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCL23P55773 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCL23P55773 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCL23P55773 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCL23P55773 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCL23P55773 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCL23P55773 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCL23P55773 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCL23P55773 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCL23P55773 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCL23P55773 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCL23P55773 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCL23P55773 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCL23P55773 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCL23P55773 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCL23P55773 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCL23P55773 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCL23P55773 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCL23P55773 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCL23P55773 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCL23P55773 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCL23P55773 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCL23P55773 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCL23P55773 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCL23P55773 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCL23P55773 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCL23P55773 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCL23P55773 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCL23P55773 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCL23P55773 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCL23P55773 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCL23P55773 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCL23P55773 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCL23P55773 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCL23P55773 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCL23P55773 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCL23P55773 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCL23P55773 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCL23P55773 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCL23P55773 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCL23P55773 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCL23P55773 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCL23P55773 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCL23P55773 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCL23P55773 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCL23P55773 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCL23P55773 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCL23P55773 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCL23P55773 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCL23P55773 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCL23P55773 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCL23P55773 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCL23P55773 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCL23P55773 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCL23P55773 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCL23P55773 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCL23P55773 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCL23P55773 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL23P55773 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL23P55773 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL23P55773 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCL23P55773 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCL23P55773 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCL23P55773 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCL23P55773 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms