Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UCNP55089 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCNP55089 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCNP55089 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UCNP55089 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCNP55089 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCNP55089 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCNP55089 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCNP55089 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCNP55089 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UCNP55089 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UCNP55089 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UCNP55089 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCNP55089 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCNP55089 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UCNP55089 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCNP55089 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCNP55089 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCNP55089 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCNP55089 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCNP55089 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UCNP55089 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UCNP55089 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UCNP55089 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UCNP55089 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UCNP55089 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UCNP55089 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UCNP55089 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UCNP55089 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UCNP55089 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UCNP55089 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UCNP55089 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UCNP55089 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UCNP55089 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UCNP55089 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UCNP55089 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UCNP55089 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UCNP55089 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UCNP55089 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UCNP55089 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UCNP55089 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UCNP55089 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UCNP55089 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UCNP55089 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UCNP55089 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UCNP55089 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UCNP55089 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UCNP55089 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UCNP55089 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UCNP55089 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UCNP55089 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UCNP55089 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UCNP55089 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UCNP55089 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UCNP55089 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UCNP55089 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UCNP55089 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UCNP55089 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UCNP55089 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UCNP55089 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UCNP55089 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UCNP55089 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UCNP55089 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UCNP55089 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UCNP55089 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UCNP55089 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UCNP55089 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UCNP55089 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UCNP55089 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UCNP55089 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UCNP55089 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UCNP55089 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UCNP55089 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UCNP55089 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UCNP55089 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UCNP55089 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UCNP55089 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UCNP55089 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UCNP55089 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UCNP55089 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UCNP55089 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UCNP55089 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UCNP55089 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UCNP55089 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UCNP55089 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UCNP55089 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UCNP55089 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UCNP55089 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UCNP55089 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UCNP55089 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UCNP55089 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UCNP55089 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCNP55089 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCNP55089 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCNP55089 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCNP55089 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCNP55089 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCNP55089 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCNP55089 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCNP55089 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms