Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP2S1P53680 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP2S1P53680 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP2S1P53680 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
AP2S1P53680 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP2S1P53680 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP2S1P53680 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms