Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDT6P53370 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDT6P53370 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDT6P53370 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDT6P53370 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDT6P53370 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDT6P53370 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT6P53370 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDT6P53370 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDT6P53370 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDT6P53370 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms