Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR9P51686 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR9P51686 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR9P51686 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR9P51686 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCR9P51686 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR9P51686 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR9P51686 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR9P51686 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCR9P51686 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCR9P51686 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR9P51686 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR9P51686 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR9P51686 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCR9P51686 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCR9P51686 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR9P51686 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR9P51686 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR9P51686 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR9P51686 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCR9P51686 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR9P51686 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR9P51686 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR9P51686 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCR9P51686 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR9P51686 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCR9P51686 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR9P51686 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR9P51686 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR9P51686 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCR9P51686 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCR9P51686 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR9P51686 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR9P51686 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR9P51686 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCR9P51686 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR9P51686 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCR9P51686 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCR9P51686 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCR9P51686 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR9P51686 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR9P51686 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR9P51686 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR9P51686 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR9P51686 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR9P51686 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR9P51686 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR9P51686 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR9P51686 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR9P51686 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR9P51686 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR9P51686 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR9P51686 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR9P51686 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR9P51686 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR9P51686 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR9P51686 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR9P51686 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR9P51686 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR9P51686 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR9P51686 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR9P51686 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR9P51686 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR9P51686 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR9P51686 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR9P51686 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR9P51686 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR9P51686 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR9P51686 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR9P51686 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR9P51686 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR9P51686 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR9P51686 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR9P51686 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR9P51686 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR9P51686 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR9P51686 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR9P51686 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR9P51686 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR9P51686 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR9P51686 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR9P51686 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR9P51686 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR9P51686 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR9P51686 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR9P51686 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR9P51686 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR9P51686 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR9P51686 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR9P51686 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR9P51686 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR9P51686 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR9P51686 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR9P51686 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR9P51686 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR9P51686 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR9P51686 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR9P51686 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR9P51686 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR9P51686 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms