Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR4P51679 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR4P51679 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR4P51679 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR4P51679 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR4P51679 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR4P51679 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR4P51679 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR4P51679 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR4P51679 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR4P51679 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR4P51679 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR4P51679 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR4P51679 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR4P51679 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR4P51679 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR4P51679 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR4P51679 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR4P51679 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR4P51679 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR4P51679 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR4P51679 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR4P51679 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR4P51679 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR4P51679 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR4P51679 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR4P51679 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR4P51679 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR4P51679 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR4P51679 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR4P51679 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR4P51679 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR4P51679 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR4P51679 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR4P51679 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR4P51679 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR4P51679 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR4P51679 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR4P51679 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR4P51679 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR4P51679 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR4P51679 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR4P51679 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR4P51679 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR4P51679 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR4P51679 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR4P51679 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR4P51679 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR4P51679 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR4P51679 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR4P51679 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR4P51679 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR4P51679 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR4P51679 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR4P51679 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR4P51679 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR4P51679 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR4P51679 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR4P51679 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR4P51679 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR4P51679 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR4P51679 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR4P51679 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR4P51679 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR4P51679 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR4P51679 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR4P51679 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR4P51679 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR4P51679 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR4P51679 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR4P51679 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR4P51679 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR4P51679 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR4P51679 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR4P51679 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR4P51679 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR4P51679 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR4P51679 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR4P51679 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR4P51679 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR4P51679 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR4P51679 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR4P51679 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR4P51679 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR4P51679 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR4P51679 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR4P51679 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR4P51679 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR4P51679 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR4P51679 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR4P51679 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms