Protein–RNA interactions for Protein: P51665

PSMD7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD7P51665 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD7P51665 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD7P51665 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD7P51665 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD7P51665 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD7P51665 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD7P51665 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD7P51665 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD7P51665 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD7P51665 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD7P51665 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD7P51665 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD7P51665 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD7P51665 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms