Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCFC1P51610 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HCFC1P51610 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HCFC1P51610 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HCFC1P51610 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HCFC1P51610 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCFC1P51610 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCFC1P51610 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCFC1P51610 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms