Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TM4SF4P48230 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TM4SF4P48230 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TM4SF4P48230 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TM4SF4P48230 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TM4SF4P48230 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TM4SF4P48230 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TM4SF4P48230 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TM4SF4P48230 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TM4SF4P48230 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TM4SF4P48230 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TM4SF4P48230 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TM4SF4P48230 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TM4SF4P48230 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TM4SF4P48230 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TM4SF4P48230 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TM4SF4P48230 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TM4SF4P48230 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TM4SF4P48230 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TM4SF4P48230 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TM4SF4P48230 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TM4SF4P48230 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TM4SF4P48230 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TM4SF4P48230 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TM4SF4P48230 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TM4SF4P48230 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TM4SF4P48230 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TM4SF4P48230 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms