Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRXP46100 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRXP46100 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRXP46100 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRXP46100 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRXP46100 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRXP46100 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRXP46100 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRXP46100 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRXP46100 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRXP46100 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRXP46100 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRXP46100 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRXP46100 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRXP46100 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATRXP46100 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRXP46100 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRXP46100 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATRXP46100 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATRXP46100 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRXP46100 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRXP46100 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRXP46100 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRXP46100 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRXP46100 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRXP46100 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRXP46100 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRXP46100 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRXP46100 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRXP46100 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRXP46100 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRXP46100 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRXP46100 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRXP46100 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRXP46100 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATRXP46100 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRXP46100 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATRXP46100 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRXP46100 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRXP46100 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATRXP46100 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATRXP46100 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATRXP46100 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATRXP46100 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATRXP46100 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRXP46100 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRXP46100 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATRXP46100 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRXP46100 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ATRXP46100 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRXP46100 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRXP46100 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRXP46100 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATRXP46100 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRXP46100 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRXP46100 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRXP46100 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRXP46100 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATRXP46100 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRXP46100 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATRXP46100 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRXP46100 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRXP46100 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATRXP46100 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRXP46100 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRXP46100 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATRXP46100 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATRXP46100 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRXP46100 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRXP46100 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRXP46100 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATRXP46100 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRXP46100 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRXP46100 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATRXP46100 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATRXP46100 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRXP46100 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATRXP46100 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATRXP46100 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATRXP46100 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRXP46100 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRXP46100 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATRXP46100 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATRXP46100 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATRXP46100 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRXP46100 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRXP46100 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRXP46100 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATRXP46100 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATRXP46100 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATRXP46100 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRXP46100 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRXP46100 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRXP46100 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRXP46100 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRXP46100 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRXP46100 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATRXP46100 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRXP46100 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATRXP46100 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms