Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3CAP42336 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIK3CAP42336 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIK3CAP42336 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PIK3CAP42336 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3CAP42336 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3CAP42336 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3CAP42336 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CAP42336 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CAP42336 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms