Protein–RNA interactions for Protein: P35813

PPM1A, Protein phosphatase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1AP35813 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPM1AP35813 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPM1AP35813 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPM1AP35813 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPM1AP35813 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPM1AP35813 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPM1AP35813 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPM1AP35813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPM1AP35813 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPM1AP35813 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPM1AP35813 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPM1AP35813 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPM1AP35813 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPM1AP35813 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPM1AP35813 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPM1AP35813 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPM1AP35813 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPM1AP35813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPM1AP35813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPM1AP35813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPM1AP35813 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms