Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CXCR5P32302 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CXCR5P32302 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CXCR5P32302 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CXCR5P32302 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCR5P32302 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCR5P32302 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCR5P32302 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CXCR5P32302 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCR5P32302 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms