Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD40LGP29965 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD40LGP29965 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD40LGP29965 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD40LGP29965 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD40LGP29965 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD40LGP29965 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD40LGP29965 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD40LGP29965 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD40LGP29965 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD40LGP29965 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD40LGP29965 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms