Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SERPINB3P29508 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERPINB3P29508 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SERPINB3P29508 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SERPINB3P29508 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERPINB3P29508 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPINB3P29508 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERPINB3P29508 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERPINB3P29508 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SERPINB3P29508 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms