Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDE4AP27815 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDE4AP27815 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDE4AP27815 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDE4AP27815 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDE4AP27815 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDE4AP27815 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDE4AP27815 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PDE4AP27815 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDE4AP27815 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE4AP27815 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE4AP27815 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE4AP27815 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDE4AP27815 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDE4AP27815 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDE4AP27815 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDE4AP27815 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDE4AP27815 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PDE4AP27815 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE4AP27815 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE4AP27815 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PDE4AP27815 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDE4AP27815 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PDE4AP27815 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE4AP27815 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE4AP27815 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE4AP27815 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE4AP27815 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE4AP27815 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE4AP27815 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDE4AP27815 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDE4AP27815 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDE4AP27815 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms