Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTNNA2P26232 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTNNA2P26232 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNA2P26232 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA2P26232 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA2P26232 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA2P26232 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA2P26232 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms