Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA4P25789 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMA4P25789 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMA4P25789 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMA4P25789 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMA4P25789 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMA4P25789 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMA4P25789 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMA4P25789 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMA4P25789 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMA4P25789 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms