Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPD1P23109 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AMPD1P23109 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AMPD1P23109 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AMPD1P23109 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AMPD1P23109 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AMPD1P23109 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AMPD1P23109 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AMPD1P23109 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AMPD1P23109 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AMPD1P23109 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AMPD1P23109 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
AMPD1P23109 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AMPD1P23109 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AMPD1P23109 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AMPD1P23109 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms