Protein–RNA interactions for Protein: P22692

IGFBP4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP4P22692 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGFBP4P22692 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGFBP4P22692 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGFBP4P22692 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGFBP4P22692 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IGFBP4P22692 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGFBP4P22692 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGFBP4P22692 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGFBP4P22692 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGFBP4P22692 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGFBP4P22692 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IGFBP4P22692 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IGFBP4P22692 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGFBP4P22692 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGFBP4P22692 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms