Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK11BP21127 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDK11BP21127 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDK11BP21127 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK11BP21127 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK11BP21127 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK11BP21127 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK11BP21127 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK11BP21127 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK11BP21127 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK11BP21127 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms