Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD247P20963 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD247P20963 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD247P20963 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD247P20963 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD247P20963 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD247P20963 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD247P20963 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD247P20963 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD247P20963 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD247P20963 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD247P20963 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD247P20963 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD247P20963 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD247P20963 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD247P20963 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD247P20963 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD247P20963 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD247P20963 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD247P20963 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CD247P20963 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD247P20963 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD247P20963 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD247P20963 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD247P20963 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD247P20963 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD247P20963 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD247P20963 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD247P20963 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD247P20963 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD247P20963 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD247P20963 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD247P20963 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD247P20963 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD247P20963 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD247P20963 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD247P20963 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD247P20963 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD247P20963 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD247P20963 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD247P20963 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD247P20963 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD247P20963 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD247P20963 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD247P20963 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD247P20963 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD247P20963 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD247P20963 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD247P20963 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD247P20963 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD247P20963 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD247P20963 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD247P20963 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD247P20963 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD247P20963 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD247P20963 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD247P20963 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD247P20963 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD247P20963 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD247P20963 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD247P20963 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD247P20963 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD247P20963 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD247P20963 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD247P20963 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD247P20963 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD247P20963 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD247P20963 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD247P20963 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD247P20963 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD247P20963 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD247P20963 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD247P20963 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD247P20963 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD247P20963 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD247P20963 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD247P20963 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD247P20963 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD247P20963 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD247P20963 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD247P20963 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD247P20963 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD247P20963 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD247P20963 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD247P20963 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD247P20963 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD247P20963 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD247P20963 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD247P20963 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD247P20963 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD247P20963 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD247P20963 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD247P20963 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD247P20963 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD247P20963 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms